Den första av sekvenseringstekniker med hög kapacitet, massivt parallell signatursekvensering (eller MPSS), utvecklades på 1990-talet på Lynx Therapeutics, ett företag som grundades 1992 av Sydney Brenner och Sam Eletr. MPSS var en pärlbaserad operation som använde en complex som var till hands för adapterligering följt av adapteravkodning, avläsning av sammankopplingen i steg om fyra nukleotider. Denna operation gjorde det mottagligt för sekvensspecifik förspänning eller förlust av specifika sekvenser. På grund av att tekniken var så complex utfördes MPSS endast "internt" av Lynx Therapeutics och nr DNA sekvenseringsmaskiner såldes till oberoende laboratorier. Lynx Therapeutics slogs samman med Solexa (senare förvärvades av Illumina) 2004, vilket ledde till utvecklingen av sekvensering-efter-syntes, en enklare tillhandahålls från Manteia Predictive Medicine, vilket gjorde MPSS föråldrade. Hur som helst var de väsentliga egenskaperna för MPSS-utgången typiska för senare datatyper med hög genomströmning, inklusive hundratusentals korta DNA -sekvenser. I fallet med MPSS användes dessa vanligtvis för sekvensering av cDNA för mätning av genform av expressionsnivåer.
Bild 151A | Flera, fragmenterade sammankopplingsanalyser måste sammanställas på grundval av deras överlappande områden. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) från Wikimedia Commons
Författare : Milos Pawlowski
Kommentarer
Skicka en kommentar