Ljusaktiverad strukturell granskning av RNA (LASER) sondering använder UV-ljus för att aktivera nikotinoylazid( NAz), vilket genererar starkt reaktiv nitreniumkatjon i vatten, som reagerar med lösningsmedel tillgänglig guanosin och adenosin av RNA vid C-8 position genom en barriärfri Friedel-Crafts-reaktion. LASER-sondering riktar sig till både enkelsträngade och dubbelsträngade rester så länge de är lösningsmedelsåtkomliga. På grund av hydroxylradikalprovning kräver synkrotronstrålning för att mäta lösningsmedlets tillgänglighet av RNA in vivo, är det svårt att applicera hydroxylradikalprovning på fotavtryck RNA i celler för många laboratorier. Medan LASER-sondering använder en handhållen UV-lampa (20 W) för excitation, är det mycket lättare att applicera LASER-sondering för in vivo-studier av RNA lösningsmedelstillgänglighet. Denna kemiska sonderingsverkan är lätt kontrollerbar och undersöker lösningsmedlets tillgänglighet för nukleobas, vilket har visat sig ge fotavtryck RNA bindande proteiner inuti celler.
Bild 231A | Reaktionsmekanism mellan 1,2-dikarbonyler och guanin. | David Mitchell III, Laura E. Ritchey, Hongmarn Park, Paul Babitzke, Sarah M. Assmann och Philip C. Bevilacqua / Attribution 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mechanism_of_glyoxal_derivatives_reacting_with_guanines.png) from Wikimedia Commons
Författare : Milos Pawlowski
Kommentarer
Skicka en kommentar