Programvara för bioinformatik och design

Användningen av plasmider som en teknik inom molekylärbiologi stöds av bioinformatikprogramvara. Dessa program registrerar DNA sammankopplingen av plasmidvektorer, hjälper till att förutsäga skära platser för begränsningsenzymer och att planera manipulationer. Exempel på programvarupaket som hanterar plasmidkartor är ApE, Clone Manager, GeneConstructionKit, Geneious, Genome Compiler, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, VectorFriends, Vector NTI och WebDSV. Dessa programvaror hjälper till att genomföra hela experiment i silico innan de gör våta experiment.

Plasmidkollektioner

Många plasmider har skapats under åren och forskare har gett ut plasmider till plasmiddatabaser, till exempel de ideella organisationerna Addgene och BCCM / LMBP. Man kan identifiera och uppmana plasmider från dessa databaser för forskning. Forskare överför ofta plasmidsekvenser till NCBI -databasen, från vilka sekvenser av specifika plasmider kan hämtas.

Bild 239A | En schematisk representation av pBR322 -vektorn med begränsningsställen indikerade i blått. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

Bild 239A | En schematisk representation av pBR322 -vektorn med begränsningsställen indikerade i blått. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

Författare : Milos Pawlowski

Referenser:

Molekylärbiologitekniker II

Tekniker för molekylärbiologi V

Kommentarer