Dynamiska genom med hög plasticitet är nödvändiga för att patogener, främst bakterier, ska kunna överleva i föränderliga miljöer. Med hjälp av sekvenseringsmetoder med hög kapacitet och silikoteknik är det möjligt att avslöja, jämföra och katalogisera många av dessa dynamiska genomiska händelser. Genomisk mångfald är viktigt vid upptäckt och behandling av en patogen eftersom dessa händelser kan ändra patogenens service och sammansättning. Det finns ett behov av att analysera mer än en enda genomkoncentration av en patogenart för att förstå patogenmekanismer. Jämförande genomik är en metod som gör det möjligt för forskare att jämföra genomen hos olika arter och stammar. Det finns flera exempel på framgångsrika jämförande genomikstudier, bland dem granskningen av Listeria och Escherichia coli. Vissa studier har försökt ta itu med skillnaden mellan patogena och icke-patogena mikrober. Denna undersökning visar sig vara svår, även om eftersom en enda bakteriesort kan ha många stammar, och det genomiska innehållet i var och en av dessa stammar varierar.
Bild 383A | Ett microarray -chip innehåller komplementära DNA (cDNA) till många sekvenser av intresse. CDNA fluorescerar när det hybridiserar med ett matchande DNA fragment i provet. | National Cancer Institute / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Microarray_Comparative_Genomic_Hybridisation.jpg) från Wikimedia Commons
Författare : Merim Kumars
Referenser:
Medicinsk mikrobiologi II: Sterilisering, laboratoriediagnos och immunsvar
Kommentarer
Skicka en kommentar