Storskalig sekvensering syftar ofta till sekvensering av mycket långa DNA bitar, som visas av hela kromosomer, trots storskalig sekvensering kan på liknande sätt användas för att generera mycket stort antal korta sekvenser, som visas i phage display. För längre mål, som visas av kromosomer, består vanliga tillvägagångssätt av skärning (med begränsningsenzymer) eller skjuvning (med mekaniska krafter) stora DNA -fragment till kortare DNA -fragment. Det fragmenterade DNA kan sedan klonas in i en DNA -vektor och amplifieras i en bakterievärd som visas av Escherichia coli. Kort DNA fragment renade från enskilda bakteriekolonier sekvensiellt sekvenseras och monteras elektroniskt till en lång, sammanhängande sammanlänkning. Studier har visat att lägga till ett storleksvalsteg för att samla DNA -fragment av enhetlig storlek kan förbättra sekvenseringseffektiviteten och noggrannheten i genomenheten. I dessa studier har automatiserad dimensionering visat sig vara mer reproducerbar och exakt än manuell gelstorlek.
Bild 149A | Ett exempel på resultaten av automatiserad DNA kedjeavslutning sekvensering. | Abizar på engelska Wikipedia / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) från Wikimedia Commons
Författare : Milos Pawlowski
Kommentarer
Skicka en kommentar